Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ0

Suv39h2, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H2, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suv39h2Q9EQQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Suv39h2Q9EQQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Suv39h2Q9EQQ0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms