Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Col4a3bpQ9EQG9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a3bpQ9EQG9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms