Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
V1ra8Q9EQ48 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V1ra8Q9EQ48 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms