Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r44Q9EQ47 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms