Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cpsf1Q9EPU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cpsf1Q9EPU4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cpsf1Q9EPU4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cpsf1Q9EPU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms