Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf1Q9EPU0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Upf1Q9EPU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf1Q9EPU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf1Q9EPU0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf1Q9EPU0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf1Q9EPU0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf1Q9EPU0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf1Q9EPU0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf1Q9EPU0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Upf1Q9EPU0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms