Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rpgrip1Q9EPQ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms