Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clstn1Q9EPL2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms