Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab13Q9DD03 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rab13Q9DD03 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rab13Q9DD03 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rab13Q9DD03 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Rab13Q9DD03 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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Rab13Q9DD03 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Rab13Q9DD03 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Rab13Q9DD03 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Rab13Q9DD03 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab13Q9DD03 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab13Q9DD03 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms