Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnft1Q9DCN7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnft1Q9DCN7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms