Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndufa8Q9DCJ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufa8Q9DCJ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms