Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Eif3fQ9DCH4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.6 ms