Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabarapQ9DCD6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GabarapQ9DCD6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms