Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MNCb-2875Q9DCB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms