Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Syde1Q9DBZ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde1Q9DBZ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms