Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Riok3Q9DBU3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms