Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc97Q9DBT3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms