Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp27a1Q9DBG1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp27a1Q9DBG1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp27a1Q9DBG1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms