Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkar1aQ9DBC7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkar1aQ9DBC7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Prkar1aQ9DBC7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkar1aQ9DBC7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prkar1aQ9DBC7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms