Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med27Q9DB40 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms