Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pop5Q9DB28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pop5Q9DB28 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms