Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn3Q9DAW9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn3Q9DAW9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms