Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf7Q9DAG9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf7Q9DAG9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf7Q9DAG9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms