Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smco2Q9DA21 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco2Q9DA21 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms