Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdzd9Q9D9M4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdzd9Q9D9M4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
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