Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp12Q9D9M2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms