Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4bQ9D9F7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Speer4bQ9D9F7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Speer4bQ9D9F7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms