Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dnajc4Q9D844 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dnajc4Q9D844 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms