Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp5Q9D7S9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Chmp5Q9D7S9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp5Q9D7S9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms