Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N6

Mrpl30, 39S ribosomal protein L30, mitochondrial, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl30Q9D7N6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Mrpl30Q9D7N6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrpl30Q9D7N6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mrpl30Q9D7N6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mrpl30Q9D7N6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mrpl30Q9D7N6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mrpl30Q9D7N6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Mrpl30Q9D7N6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mrpl30Q9D7N6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mrpl30Q9D7N6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl30Q9D7N6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms