Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn23Q9D7D7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn23Q9D7D7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn23Q9D7D7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn23Q9D7D7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn23Q9D7D7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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