Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnfsf13Q9D777 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13Q9D777 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfsf13Q9D777 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms