Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc94Q9D6J3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms