Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttc9bQ9D6E4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc9bQ9D6E4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Ttc9bQ9D6E4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ttc9bQ9D6E4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms