Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptp4a3Q9D658 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptp4a3Q9D658 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptp4a3Q9D658 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms