Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc39Q9D5Y1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms