Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sf3a3Q9D554 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sf3a3Q9D554 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms