Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpc6Q9D4E6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pabpc6Q9D4E6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpc6Q9D4E6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms