Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odf2lQ9D478 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odf2lQ9D478 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odf2lQ9D478 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms