Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfap53Q9D439 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cfap53Q9D439 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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