Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stag1Q9D3E6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms