Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms