Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Obox1Q9D350 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Obox1Q9D350 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Obox1Q9D350 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms