Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramef12Q9D2F1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms