Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms