Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2bQ9D1Y9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2bQ9D1Y9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms