Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan11Q9D1D1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan11Q9D1D1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms