Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syf2Q9D198 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms