Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms