Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ribc1Q9D0B8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ribc1Q9D0B8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms